1、核糖核酸序列

Strand NGS支持广泛的工作流程，用于分析和可视化RNA-Seq数据。工作流程包括针对不同实验条件的标准差异表达分析，以及差异剪接分析。它支持新的发现，包括识别新的基因和外显子以及新的剪接连接。它包括检测转录组中变异的能力，以及检测基因融合事件的能力。进一步的下游分析，如GO，途径分析等，可以在一组有趣的基因上进行。

2、脱氧核糖核酸序列

Strand NGS支持广泛的工作流程，用于分析和可视化DNA-Seq数据 - 例如来自全基因组，全外显子组或靶向重测序实验。该工作流程包括检测变体（SNP、MNP 和短 InDels）的能力，使用 dbSNP 对其进行注释，并确定对非同义编码 SNP 转录本的影响。可以对受影响的基因集进行进一步的下游分析，例如GO，途径分析等。较大的结构变化，包括大的插入、缺失、倒置和易位，也可以通过配对末端或配对数据进行检测。此外，可以使用肿瘤-正常对检测拷贝数变化。

3、ChIP-Seq

Strand NGS 支持用于分析和可视化 ChIP-Seq 数据的工作流程。该工作流程能够使用富集区域检测、PICS或MACS峰检测算法鉴定转录因子结合位点和组蛋白修饰位点。它支持使用GADEM检测峰区域中的基序，并扫描基因组或感兴趣区域中的已知基序。转录起始位点的标准化读取覆盖率可以使用 TSS 图进行可视化。此外，下游分析如GO，途径分析等。可以在受影响的基因集上进行。

4、小核糖核酸序列

Strand NGS支持用于分析小RNA数据的广泛工作流程。它提供了确定各种小RNA物种表达水平的能力。它支持新型小RNA基因的检测及其类型的预测。它提供了识别差异表达的小RNA基因的能力，并在小的RNA特异性基因视图中可视化结果。有趣的小RNA基因的mRNA靶标可以从多个靶标预测数据库中鉴定出来。

5、甲基-Seq

Strand NGS支持广泛的工作流程，用于分析和可视化甲基Seq数据 - 例如来自全基因组或靶向实验的数据。该工作流程包括检测单个样品中的甲基化的能力，可用于进一步观察样品/靶区域的差异甲基化胞嘧啶，还可以研究基因水平的甲基化效应。可以对受影响的基因集进行进一步的下游分析，例如GO，途径分析等。

6、通路分析

Strand NGS中的通路分析能够对实体进行功能分析，以了解它们在生物过程中的作用。Strand NGS中的工作流程有助于识别在实验中具有重要意义的基因。这些基因和与之相关的数据可以叠加在通路上。Strand NGS提供对WikiPathways和BioCyc等精选途径来源的直接访问。它还与专有的NLP派生交互数据库打包在一起，从中可以构建文献派生网络。

安装激活教程

1、在本站下载并解压，如图所示

2、安装程序，勾选我接受协议

3、安装目录设置

4、安装完成，将crack中的bin文件夹复制到安装目录（C:\Program Files\Strand\StrandNGS）

StrandNGS是一个集成平台，为下一代测序数据提供分析、管理和可视化工具。它支持RNA-序列、DNA-序列、ChIP-序列、甲基序列、MeDIP-序列和小RNA-序列实验的工作流程