BioDiscovery Nexus Copy Number破解版是功能强大的遗传变异分析软件!主要是对研究队列中的遗传变异进行视觉和统计分析,提供领先的功能和技术,友好的用户界面,终极统计分析工具,采用黄金标准 CNV 调用算法,从各种 NGS 数据(WES、WGS、目标面板和浅排序
BioDiscovery Nexus Copy Number破解版是功能强大的遗传变异分析软件!主要是对研究队列中的遗传变异进行视觉和统计分析,提供领先的功能和技术,友好的用户界面,终极统计分析工具,采用黄金标准 CNV 调用算法,从各种 NGS 数据(WES、WGS、目标面板和浅排序)以及微阵列数据中获得复制号码和 BAF。 交互式可视化和强大的统计工具允许检测结构变异(例如拷贝号、纯合区域),与序列变异的关联(点突变、InDEL、反转等),寻找模式并发现重要生物学问题的答案,整合表型和基因组数据以揭示重要的遗传相关性,可并行分析和可视化多个样品,使用几种不同的比较类型之一以查找生物学上重要的亚组之间的统计学显着基因组变化。通过整合 mRNA、miRNA、序列变异、甲基化和拷贝数变化来识别基因组变异的重要区域。强大的工具,不需要丰富的生物信息学专业知识!
功能特色
1、寻找模式并发现重要生物学问题的答案
Nexus Copy Number软件使研究人员能够跨研究队列分析多种数据类型——阵列、NGS 面板、WES/WGS 和表达数据,以获得全基因组视图。通过各种高级分析和可视化工具,以令人难以置信的简单性揭示新的见解。
2、整合表型和基因组数据,以揭示重要的遗传相关性。
关联无限数量的样本注释或属性,用于进一步的下游分析。使用预测能力工具查找表型属性与基因组变化之间的相关性,对癌症样本进行生存分析(使用 Kaplan-Meir 图),或根据畸变谱和表型对样本进行分层以识别驱动突变。结点副本编号支持使用 K 均值或分层聚类进行分组,并能够调整聚类数。使用GSEA识别富集在整个基因组中的基因本体(GO)术语,或发现仅在选定区域中显着过度代表的GO术语。使用相关函数识别与拷贝数变化、LOH 区域或小突变同时发生的基因组改变,并在圆图中描述这些关系。
3、并行分析和可视化多个样品,无需生物信息学专业知识。
Nexus Copy Number为您提供强大的统计功能和丰富的交互式图形,无需图形和统计编程专业知识。它是一个功能强大的桌面(Windows或Mac OS)解决方案,允许并行可视化和分析数万个高密度阵列。内置了许多统计功能,使您可以轻松执行大型队列分析以及单个样本分析和可视化。分析设置允许灵活和自定义的分析。
4、比较亚组之间的基因组图谱,以确定统计学上的显着差异。
使用几种不同的比较类型(即配对,顺序)之一,查找生物学上重要的亚组之间的统计学显着基因组变化。结果可以表格格式或交互式图形显示方式查看。并行查看指定子组的频率图,以及显示明显不同区域的指标。
5、比较亚组之间的基因组图谱,以确定统计学上的显着差异。
使用几种不同的比较类型(即配对,顺序)之一,查找生物学上重要的亚组之间的统计学显着基因组变化。结果可以表格格式或交互式图形显示方式查看。并行查看指定子组的频率图,以及显示明显不同区域的指标。
6、通过Nexus DB存储库从GEO和TCGA查询多个项目中的区域/基因。
Nexus Copy Number与 Nexus DB 基因组数据存储库捆绑在一起,允许查询来自 GEO、TCGA 等的数千个样本的类似像差。搜索关键字以查找具有特定注释的类似项目或示例。您可以使用安全的数据共享方案与同事共享数据并进行协作。添加 TCGA Premier产品,允许访问来自 TCGA 的高质量和手动策划的数据,以进行涉及生存分析或肿瘤亚型分析的更深入研究。
闪电小编说明:
视觉和统计分析软件,主要是为研究人员提供先进的基因组数据分析和可视化工具。 易于使用的软件提供了尖端的统计工具,以促进科学发现。