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Cresset-BMD Flare v9.0.0

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         Cresset-BMD Flare是用于基于配体和结构的药物设计的绝佳解决方案,让药物研究、开发设计人士能够仔细地检查配体,深入了解其蛋白质靶标和配体,放心地进行先导化合物优化。现在用户不需要花费大量的时间就能获得优化的结果,更具信心地制定决策,准确地计算
Cresset-BMD Flare是用于基于配体和结构的药物设计的绝佳解决方案,让药物研究、开发设计人士能够仔细地检查配体,深入了解其蛋白质靶标和配体,放心地进行先导化合物优化。现在用户不需要花费大量的时间就能获得优化的结果,更具信心地制定决策,准确地计算和简单地操作,便捷地沟通,Flare V9在最新解决方案中带来Spark生物等排体替换、同源建模、集成 MM/GBSA 等一系列新增和改进,为所有用户带来了新的和增强的科学功能和方法。

v9新功能

1、简化分子发现,从新想法的产生到Flare内的广泛优化 
Spark中的Bioisostere替换在静电和形状产品空间中工作,以更好地描述分子的生物活性,从而能够创建新的IP用户友好的向导驱动访问各种实验。访问优秀的Bioisotere源以生成新的项目想法通过Flare Python API创建自定义工作流和自动化任务来提高效率 
2、基于配体和结构的药物设计火炬 
通过高分辨率3D可视化和对靶结构和潜在配体的深入分析,Flare使用户能够高效有效地优化和优先考虑新分子。
3、使用各种各样的实验为您的项目产生高度创新的想法
为核心组和终末组寻找与生物学相关的替代品 
将配体放入空口袋 
从真实的化学中识别连接体,以连接两个配体
4、 MM/GBSA动力学 
分子力学/广义玻恩表面积(MM/GBSA)是一种计算配体-蛋白质结合自由能的方法。通过在MD轨迹过程中平均MM/GBSA结合自由能来估计一组配体的结合自由能,以获得更准确的结果。 
5、 同源性建模 
同源建模是一种在靶蛋白的3D结构尚不清楚且只有其一级序列可用时构建靶蛋白3D模型的方法。该方法依赖于在Flare中构建精确模型的两个要求:与靶标具有相似序列和功能的蛋白质的3D实验确定结构,以及氨基酸的靶标序列。
6、 Flare V9中的其他新功能和增强功能可以自信地推进优化: 
更高度可定制的选项,用于微调动力学模拟 
自定义执行Flare FEP计算每个步骤的条件,以及更直观的条件 
故障排除工具 
无缝管理Python扩展,以访问高级数据可视化和计算 
通过增强的扩展管理器实现功能 
使用JupyterLab Notebook集成编写、保存和运行自己的脚本

功能特色

1、基于配体的药物设计软件组件
基于配体的药物设计者利用 Flare 根据分子的形状、静电和结合活性对其分子进行仔细检查、比较和确定优先级。通过预测新化合物的活性和 ADMET 特性的强大 QSAR 模型,用户可以在整个潜在客户组合中建立信心和理解。
2、基于结构的药物设计软件组件
借助多种方法,包括对接和评分、静电互补性™、分子动力学、口袋分析和水分析(GIST 和 3D-RISM),基于结构的药物设计人员可以获得对蛋白质-配体结合的新见解。基于围绕配体和蛋白质静电的既定专有方法,结合我们自己的内部和开源研究,用户能够充分了解其目标结构的特征和相互作用。
3、Flare 中的 Spark
通过无缝访问 Flare 的 Cresset 生物等排体替代解决方案 Spark™,进一步简化您的分子设计工作流程并提高您的生产力。
4、Flare 扩展和集成
借助 Python API,Flare 功能是完全可自定义和可扩展的。无论是通过开发自己的扩展,还是希望包含 Cresset 的预制扩展之一,Flare 的 Python 集成都提供了对各种新功能和专用菜单的访问。Flare 还与 DMTA 协作工具 Torx 无缝连接,以简化整个 DMTA 周期的协作。

安装激活教程

1、安装包如图所示

2、安装程序,勾选如下选项

3、安装文件夹设置

4、将文件夹\patch\Cresset BMD\复制到默认C:\Program Files\中

闪电小编说明:

Flare通过高分辨率 3D 可视化和对靶结构和潜在配体的深入分析,Flare 使用户能够高效且有效地优化新分子并确定其优先级。全新的CADD解决方案,包括同源建模,为无法获得晶体学信息的蛋白质靶标创建可靠的 3D 模型,在动力学轨迹上集成分子力学/广义出生表面积 (MM/GBSA) 以估计结合自由能,在 Flare 中完全整合 Spark,以及增强的蛋白质制备。通过仔细检查广泛的想法组合并应用各种方法,可以将大量分子简化为一个小集合,只允许将最好的分子移交给实验室实验。结果不仅大大减少了时间、精力和实验室资源,而且在后期药物开发中也有最大的成功机会。

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