Lixoft开发用于基于模型的高级药物开发的建模和模拟软件。其产品为临床前,临床试验和治疗个体化中的人口分析提供了强大而简便的解决方案。 Lixoft的技术是十年来统计和建模研究项目的成果,由Inria领导, 用于高级人口分析,药物学,临床前和临床试验建模与
Lixoft开发用于基于模型的高级药物开发的建模和模拟软件。其产品为临床前,临床试验和治疗个体化中的人口分析提供了强大而简便的解决方案。Lixoft的技术是十年来统计和建模研究项目的成果,由Inria领导, 用于高级人口分析,药物学,临床前和临床试验建模与模拟的非线性混合效应模型。Monolix是用于制药学的非线性混合效应建模(NLME)的最先进和简单的解决方案。它基于SAEM算法,即使对于复杂的PK / PD模型也能提供强大的全局收敛。Monolix用于临床前和临床人群PK / PD建模和系统药理学。Lixoft Monolix Suite可立即生成Visual Predictive Check,为您的复杂PK / PD模型生成完整的诊断图表。它涵盖了各种数据类型以及用于群体PK / PD建模的统计特征。
新功能
1、全球互操作性
*扩展的互操作性,可将PKanalix、Monolix或Simulx运行导出到MonolixSuite的任何其他应用程序。
除了现有的出口/进口,现在还可以:
-将PKanalix CA运行输出到Simulx,以预测这些相同的个体对另一种给药方案的反应。
-将Simulx运行或Monolix单独拟合或VPC模拟导出到PKanalix,以在模拟数据上运行NCA。
2、全局显示
*基于自定义Word模板文件自动生成报告的报告模块:
-占位符可以写入任何Word模板文件中,在生成报告时,它们将被PKanalix或Monolix运行的绘图和表格替换
-可以在GUI中为每个绘图和表格轻松生成占位符,然后将其复制到Word模板中
-可以自定义绘图和表格的占位符,以便在报告中显示所需的内容
*可以为观测数据和VPC图设置自定义轴限制。
*在“观测数据”图中,在同一图上,不同组的趋势线(平均值和标准误差)可以通过协变量分割后合并。
*现在可以直接从MonolixSuite的任何应用程序的界面发送软件反馈。
3、数据集
*接口中的数据格式化模块,使输入格式更加灵活。
从输入数据集(尚未采用MonolixSuite格式),现在可以:
-合并多个观测类型
-基于BLQ标签添加审查信息
-从外部文件中添加治疗信息,或手动指定多种可能性(多剂量方案、重复周期、输注、联合疗法、剂量取决于类别、使用剂量间隔等)
-从另一个文件中添加协变列和回归列
4、PKanalix公司
*[单位]数量列、每体重或体表面积的其他标准化单位。
*[CA任务]可以使用CA中的任何模型,使用mlxtran语法或从MonolixSuite库中自行编写。
*[CA任务]CA中的改进算法,以逃避更好的局部最小值并改进拟合(对于比标准pk更复杂的模型很重要)。
*[CA任务]基于广义最小二乘法的新成本函数,能够将模型与AIC和BIC进行比较。
*[CA任务]新加权选项1/|Ypred*Yobs|。
*[CA结果]单个参数表中报告了单个成本,新的成本选项卡显示了全局成本、-2LL、AIC和BIC的值。
*[CA图]对于CA,新的观察值与预测值绘制图以诊断拟合。
*[结果]其他汇总度量几何CV和调和平均值。
*[首选项]NCA参数名称和摘要度量名称的自定义别名,它们出现在表、图和报告中。
5、Monolix公司
*[结果]除了群体参数表中随机效应的标准差外,还报告了变异系数。
*[数据]顺序方法现在更容易了,因为来自另一次运行的PK参数可以直接在接口中作为回归函数添加到数据集(通过数据格式化模块)。
6、Simulx公司
*[结果]在表和图中,将个人的模拟ID映射到来自Monolix运行或用户定义的外部元素的原始标识符。
*[图]现在可以在同一图上合并不同组的模拟输出分布。
*[定义]导入Monolix运行后创建的新元素,以模拟共变或参数不确定性对典型个体的影响(omegas设置为零)。
*[结果]计算结果的更多后处理可能性,如
-低于、高于或在特定值之间的持续时间,
-自定义时间的输出值,
-相对于最小/最大值的标准化(除基线值外)
-将报告时间的结果定义为连续或事件类型
*[定义]一键将单个元素转换为群体元素,反之亦然。
*[绘图]设置视觉提示后,视觉提示自动切换到OFF。
7、Lixoft连接器/命令行
*新的Monolix连接器用于从R。
*新的Simulx连接器,用于定义和计算界面中的结果和端点。
*新的连接器覆盖了接口中可用的新功能(formatData、generateReport、getCACost)。
*新函数reportGenerator可直接从命令行生成报告。
*使用与GUI中相同的过滤器选择库模型的新连接器。
*改进了未识别参数时的错误和警告消息。
*Simulx连接器的大量文档,包括每个功能的详细描述和工作示例。
*setConsoleMode(在GUI中显示计算进度)现在也可用于Simulx和PKanalix。
8、更新:
*ODE求解器CVODE升级到5.5版。
9、修复的错误:
=====全球互操作性
*[export]已修复在共享驱动器上导出时文件导出速度慢的问题。
=====全局显示
*[观察数据]当去除点和线时,设置为始终可见的给药时间消失。
*[观察数据]轴限值基于点,即使点未显示在绘图上。
*[plots]对于所有绘图,“随机颜色”选项都不起作用(单击它时不会发生任何事情)。
*[观察到的数据]当一个图被拆分并分页时,图例在从一页转到另一页时没有正确更新。
*[libraries]从库中选择模型时显示的参数并不总是模型的输入参数。
=====数据集
*[数据解释]在一些非常特殊的情况下,当在CENS列中加载带有“1”的数据集时,它被认为是右删失而不是左删失。
*[协变量统计]分层协变量未出现在协变量统计选项卡中。
=====PKanalix公司
*[计算]即使对于不使用lambda_z的参数,也使用验收标准来筛选个体。
*[设置]如果选择了部分AUC,则无法从计算参数列表中删除任何部分参数。
*[结果]在个人评估表中,ID和场合显示为双倍,而不是整数。
*[data]PKanalix在重新加载数据集中使用Cc作为头的项目时崩溃。
*[首选项]有效数字不适用于结果表中的所有值(仅适用于当前显示的行)。
=====单片
*[检查初始估计值]除正态分布外的观察模型未被自动初始化算法正确处理。
*[统计模型]错误参数的名称基于加载模型后Monolix首先给出的默认观测名称,如果手动更改映射和观测名称,则不会修改这些名称。
*[统计模型]显示公式时,垂直滚动条消失。
*[plots/VPC]选择和取消选择“最后一次剂量后的时间”并没有使箱子恢复到相同的状态。
=====西克莫无花果
*在比较选项卡中,未显示RSE的NaN,单元格显示为空。
*当选择仅包含一个mlxtran文件的文件夹时,文件夹和“扫描”按钮不会出现。
=====模拟
*[模拟]只有一个时间段时,没有考虑到时间间的可变性。
*[结果]即使只有一个复制,结果中也会显示端点摘要选项卡。
*[结果]重命名结果与组比较摘要中的结果重复。
=====Lixoft连接器/命令行
*[getChartsData]getChartsData计算所有绘图的图表数据,即使请求了特定绘图。
*[defineTreatmentElement]通过协变量缩放治疗的选项在GUI中可用,但在连接器中不可用。
*[definePopulationElement]尝试使用多行设置填充参数元素时,出现崩溃而不是错误。
*[setGroupElement]将多个元素设置为同一模拟组时出错。
*[命令行]选项--如果使用选项“-t monolix”,则不考虑gui。
*[newProject]newProject无法使用modelFile=“lib:…”。
*[deleteOccasionElement]如果项目中不存在任何场合,deleteOccasonElement将删除mlx_Cov。
*[setData]setData(以及使用它的Rsmlx函数:bootmlx、confintmlx)在某些情况下未正确设置某些计算机上的数据,导致错误“观察类型和数据文件输入之间的观察名称不一致”。
*[define..Element]常见元素的场合定义没有适当考虑场合列。
*[getTreatmentElements]getTreatment Elements()返回了截断的行数。
Lixoft Monolix Suite激活教程
1、在本站下载并解压,如图所示
2、安装程序,安装目录
3、勾选我接受协议
4、从medicine
中将lixoft文件夹粘贴到C:\运行rlm.exe,
5、创建系统环境:LIXOFT_LICENSE=5053@localhost
6、运行程序,如图所示,载入你的lic许可证,点击load
闪电小编说明:
Monolix Suite包含五个应用程序,Datxplore用于数据探索和可视化的图形和交互式软件。PKanalix用于非隔室和隔室分析的图形和交互式软件。Mlxplore用于探索和可视化复杂药物模型的图形和交互式软件。Monolix用于非线性混合效应模型中的参数估计,模型诊断和评估以及高级图形表示的简单,快速和强大的工具。Simulx用于临床试验药物学的强大而灵活的模拟器。