1、频谱补偿允许用户收集的通道数超出其参数,如果正确完成操作,则可以获得更清晰的数据。在光谱流中,所有参数的所有检测器中都收集有光,附加信息使软件可以更精确地分离出各个颜色。
3、从设计到发现,BD和FlowJo都会继续支持您和您的研究。现在,借助新的BD FACSDiva™支持,用户可以导入和导出门以及直接对BD FACSDiva™实验进行补偿。
5、更新到Java版本9
软件功能
1、使用FlowJo进行分析
您会发现操作FlowJo的模式可能与以下一系列步骤非常相似:
将样品加载到工作区中。
为相关样本,门等创建组。
详细分析单个样本,创建门,统计信息等。
将适当的分析应用于组中的所有样本。
检查组中样本的门:可以轻松进行修改以适应样本之间的差异。
生成 图形布局 ,您可以在其中显示所有样本中的特定图形。
生成一个 表 ,您可以在其中创建所有样本的特定统计信息。
如果对不同的患者进行了类似的实验,则可以将工作空间另存为 模板, 其中包含所有门,统计信息,表格和布局。下周,当您对不同的患者进行相同的实验时,大部分工作已经为您完成!您只需要将新样本导入模板工作区。好的模板设计可以节省大量的软件分析时间,并使报告标准化。
2、后退分析
一旦您的分析包含门内选通产生的亚群,查看以图形方式呈现给定亚群的来源将很有用。 Backgating 分析显示每个选通操作的图形,并在每个阶段的图形中突出显示最终的子种群。
3、批处理操作
批处理操作(对多个样本执行的重复分析)可用于 在FlowJo 中创建 布局 和 表格。通常,对当前组中的所有样本执行批处理操作(因此,您将需要创建 将有助于您生成批输出的样本 组)。这样,FlowJo是一个程序,不仅可以分析单个数据样本。相反,重点是一次分析样本,实验甚至是多个实验的组。
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4、细胞周期分析
FlowJo具有一个 Cell Cycle Platform ,该平台使用多个模型拟合数据,约束拟合参数并自动计算G1,S或G2相中的细胞百分比。可以使用与用于传播其他门或分析相同的简单拖放界面,将所有模型复制到其他种群或样本。
5、补偿金
污点的光谱重叠在FlowJo的补偿工具中处理。用于计算补偿矩阵的 接口 基于单个染色的控制样本的集合。然后,您可以将此补偿矩阵应用于多色样本。FlowJo将补偿参数添加到多色样品中,以便您可以查看和分析补偿数据。
6、派生参数
FlowJo使您 可以定义 样本的新参数。这些可以包括缩放参数(以扩展关注区域),时间参数(用于执行动力学分析),比率参数或在对数和线性缩放之间转换的参数。可以将派生的参数定义复制到整个样本组。
7、实验,工作区 和组
实验可以是单个样本集合,也可以是几个月内跨多个集合的实验。无论您的研究规模或时间范围如何,该软件都足够灵活,可以满足您的实验需求。的工作空间显示了样品群体(的层次结构盖茨)和统计信息被在分析创建。您可以随时保存,关闭和重新打开工作区,然后从上次中断的地方开始。您可能同时打开多个工作空间,并在工作空间之间拖放示例和门。工作空间包括已应用的门,计算的统计信息以及表格和图形布局您设计的。如果保存工作区,则将保存所有方面。在工作空间内,可以根据所选属性将样本添加到组中 。例如,您可以制作一组具有相似污渍的样品,或按患者分组。组是FlowJo的强大功能,当您对组执行操作时,它将对属于该组的每个样本执行操作。
8、FCS扫描
该 FCS扫描 工具会扫描本地或远程文件系统FCS文件。当您要查找符合特定条件(染色协议,操作员ID,运行日期,机器等)的FCS文件时,或者当FCS文件已被移动并需要重新放置时,此实用程序非常有用。
9、门控层次
FlowJoe的另一个基本概念是 门控层次结构。当您首次在样本上生成门(即淋巴细胞门)时,FlowJo在家谱树范式中向您显示此门(亚群)。换句话说,淋巴细胞亚群是母体样品的子代。它显示在工作区中在样品下面,从样品上缩进一个水平。如果您要在样本(例如单核细胞)上做另一个门,FlowJo将创建另一个新的子集作为样本的另一个子对象。现在,淋巴细胞和单核细胞门是兄弟姐妹。您可以对样本执行的任何操作也可以对样本的子集执行。因此,您可以查看淋巴细胞子集并创建该种群的门(子集)。如果您在淋巴细胞内创建T细胞门,则T细胞子集将成为淋巴细胞的子代(并由此扩展为样本的孙代)。
10、动力学(Ca ++通量)分析
FlowJo提供了一个复杂的平台,旨在分析 动力学 数据。FlowJo寻找与时间相对应的参数(并命名为“ Time”);如果不是,则FlowJo允许您创建时间参数(假设事件发生率恒定)。在Kinetics平台上,您可以计算最大响应时间,响应斜率,响应单元的分数等。
11、电影
FlowJo独有的分析平台:动态查看数据。使用图形窗口或布局编辑器影片根据时间生成图形(运动分析),或根据一个参数生成一个或两个参数的图形作为第三函数。这种独特的可视化功能使您可以发现数据中微妙的关系,否则这些关系将无法看到。
12、印版编辑器
一个全新的平台,用于对基于板的流式细胞仪数据进行注释,分组和组织,该平台具有用于板元数据注释的工具,导入用于快速板注释的CSV文件以及设置用于滴定的注释的功能 。
13、统计和公式
可以对子种群执行大量标准 统计计算,然后通过分批将其推广到整个实验。FlowJo将在您指定的样本组之间建立统计分析表。只要您修改实验,这些表格就会不断更新。例如,对门的更改将导致与门相关联的任何统计信息更新。您可以将表导出 到电子表格或数据库。您还可以在FlowJo中设计和应用自己的公式,并使用其工具来完成跨多个总体的分析,而无需进行繁琐的工作。您创建的表可以从一个工作区拖放到另一个工作区。
14、扩散分析
的 增殖平台 用于获得使用细胞作为跟踪CFSE染料例如模型增殖数据。FlowJo呈现图形显示以及有关子集中每一代的信息。增殖平台还提供有关原始群体中已分裂的细胞比例以及这些细胞分裂次数的信息。此外,该平台还绘制了分隔各个世代的大门。
安装激活教程
1、在本站下载并解压,如图所示,
2、双击FlowJo-Win64-10.6.2.exe运行安装,选择安装位置
3、安装完成,退出向导
4、将b-fj162.exe复制到安装目录中,运行,点击patch按钮
FlowJo是用于查看和分析流式细胞仪数据的集成环境。FlowJo的优势在于分析涵盖许多相关样本的整个实验。除了门控和统计之外,FlowJo还拥有专门的分析平台,用于涉及DNA /细胞周期,动力学和增殖等的分析。FlowJo的复杂工具允许生成统计信息,图形,表格,网页甚至电影。FlowJo集成了远程数据托管服务(LIMS),并支持云部署,以在苛刻的高吞吐量环境中实现出色的性能扩展。
更新日志
10.6发行说明
新功能:
光谱补偿现在可用于在补偿向导中补偿由超定系统(比荧光探针更多的检测器)收集的数据。
现在可以覆盖FlowJo v10中由Platforms生成的图形!是的,您已正确阅读,现在可以在FlowJo的布局编辑器中叠加:动力学,细胞周期和增殖平台图。
自动保存工作区功能–新的首选项设置使研究人员可以在可自定义的时间间隔内自动保存分析。许多研究人员都要求使用此流行功能,并且我们听到了您的声音。
FACSDiva™分析现在通过一组功能集成在FlowJo中,这些功能可从FACSDiva™工作区导入门控,并从FlowJo导出门作为FACSDiva™XML工作区文件。
更新
“光谱补偿”选项可用于补偿“补偿向导”中适当收集的数据。
布局编辑器中现在提供以下平台叠加:动力学,细胞周期和增殖。
自动保存工作区功能–新的首选项设置使研究人员可以在可自定义的时间间隔内自动保存分析。许多研究人员都要求使用此流行功能,并且我们听到了您的声音。
安装最新版本的FlowJo不再自动覆盖Windows计算机上的先前安装,并且现在对安装进行了版本控制。
将覆盖范围从单变量切换为双变量不再删除先前设置的总体着色。
修复了以前在某些工作流程中停止工作的键盘快捷键。
现在,颜色映射图不再基于每个总体进行归一化,而是严格利用研究人员为与Graph Windows相关的“自定义轴”对话框中的参数设置的缩放比例。
现在,颜色映射图在切换时可以正确显示“大圆点”和“显示网格”。
现在在祖先图中正确显示了四重门。
现在可用于FlowJo的多图颜色映射 –使研究人员可以将感兴趣的参数快速地颜色映射到双变量图上。对于说明tSNE等嵌入式空间的趋势特别有用。
CytoFlex数据文件现在可以正确连接;以前的关键字格式错误。
导出对话框中,“不超过”下采样选项现在再次起作用。
对数和Biex变换现在包括正十进制滑块,用于结合宽度基础和负十进制来调整渐近十进制的大小。
现在,SampleID扩展仅限于在此处保持空白b / w分类值。
FACSDiva™门控现在可以导出和导入。
现在可以通过特殊对话框使用自动命名列标题功能。
“另存为ACS”对话框现在说明了浏览器中的其他文件。
已知的问题
单击右上/左上角的“ x”图标无法关闭FlowJo Portal身份验证对话框。 解决方法: 单击“取消”图标以终止对话框。
身份验证–在某些使用情况下,24小时离线宽限期(对于FlowJo网站许可序列号用户)将无法正确激活。
在不创建名称的情况下,将模板保存的工作空间保存在与创建模板的工作空间相同的位置,将覆盖原始工作空间。 解决方法: 确保对工作空间进行唯一命名。
双击ACS文件将打开FlowJo,但不会打开工作区本身。 解决方法: 通过将ACS文件拖放到打开的FlowJo工作区中,或通过“文件”选项卡/“打开”对话框来加载ACS文件。
FlowJo不允许用户用文本替换关键字值系列中的数字。 解决方法: 使用键盘上的Tab键遍历正确的字段以输入关键字。
在命名对话框中连续滚动到总体名称的末尾会引发错误。
与组拥有的门相比,应用于组的扩散节点将不会具有相同的功能,即,当一个节点发生更改时,应用于同步组的扩散节点将不会自动调整,并且扩散节点的颜色/字体样式将与它们的组不匹配。
补偿金
使用补偿向导期间对参数比例的更改将重置在该对话框中所做的更改。 解决方法: 在补偿之前设置参数的缩放比例。
FlowJo Envoy浏览器
单击“否”以替换FlowJo Envoy工作流程中的文件,将关闭浏览器。
打开与当前正在使用的另一个FlowJo Envoy区域关联的工作空间时出错。 解决方法: 仅访问与您当前的FlowJo Envoy环境关联的工作空间。
可以将非标准字符作为文件或工作区名称(包括空格和加号)输入,这可能会导致下游问题。 解决方法: 请确保仅将标准字母数字字符用于数据并分析文件命名。
布局和表格编辑器
共享工作区时,标题图标不会在计算机之间转移。
使用NxN绘图批量处理布局可能会导致工作空间损坏。 解决方法: 批处理后创建NxN个图。
批处理文本框无法编辑。
调整覆盖图的设置时,控制人群可能会失去控制状态。
外挂程式
当文件或文件路径包含空格或特殊字符时,基于R的插件将不起作用。 解决方法: 从数据文件和文件路径中删除空格和特殊字符。