新功能
FEP+
- 引入未定义的立体化学中心时显示用户友好的消息 [2022-4]- 改进了 FEP+ 组组合在管理质子化和互变异构态集合方面的可用性 – 用于更准确的 ΔΔG 预测 [2022-4]
恒定 pH 模拟（测试版）
- 改进了恒定 pH 模拟的可用性，用于蛋白质 pKa 计算，输出友好 [2022-4}
量子力学
- 在 TDDFT/TDA 近似下计算激发态的 ESP 电荷 [2022-4]- 在 Windows 上使用并行捷豹计算更快地完成计算 [2022-4]- 新的工作流程操作菜单，指导绘图刚性/松弛扫描的后续步骤 [2022-4]- 文档中的 80 多个捷豹输入文件示例 [2022-4]
目标验证和结构支持
蛋白质制备
- 在 Windows 上打开蛋白质制备工作流程界面时显著加速 [2022-4]- 通过限制不相关的 CCD 键分配错误通知，减少了蛋白质制备工作流程日志文件的详细程度 [2022-4]- 蛋白质可靠性报告将即时生成测试反射（如果在提供的 .cv 文件中不可用），并报告 RSCC 值 [2022-4]- 将 PROPKA 更新到（最新）版本 3.4 [2022-4]
蛋白质 X 射线细化 - 引入 GlideXtal 命令行工具，用于晶体学电子密度图中的自动配体拟合 [2022-4]- PrimeX 最小化能够使用 CIF 格式的结构因子 [2022-4]- 在 Phenix/OPLS 中现在可以去除所有与晶体配合冲突的实体 [2022-4]- Phenix/OPLS 对标准残基中缺失的原子更可靠 [
2022-4]
冷冻电镜模型细化
- 用于将配体放置在冷冻电子密度图中的 Beta GlideEM 接口 [2022-4]- GlideEM 现在接受压缩（CCP4、MRC、MAP）文件作为输入 [2022-4]
多序列查看器/编辑器
- 蛋白质家族比对和注释的 beta 版本[2022-4]。
名为“族特征计算”的新类别位于“其他任务”
中。菜单显示蛋白质家族的比对和注释
。支持激酶和GPCR比对
。支持GPCR区域的
注释- 树状图悬停工具提示显示距离信息 [2022-4]IFD-MD- 膜结合IFD-MD教程 [2022-4]- 共价配体IFD-MD
教程 [2022-4]溶解度FEP（测试版）
- 以logS单位显示溶解度结果的选项 [2022-4]
平台环境
Maestro图形界面
- 创建和共享自定义可视化预设 [2022-4]- 添加了将DNA/RNA突变为标准核碱基的支持 [2022-4]- 新的工作流程操作菜单，用于指导绘图刚性/松弛扫描的后续步骤 [2022-4]- 新2D草图器的第一个完整版本 [2022-4]- 开始使用添加到文档中的Maestro视频系列 [2022-4]工作流程和流水线 [KNIME 扩展]
- 包含最新版本的 KNIME （v4.6.1） [2022-4]- 现在可以在相位筛选节点中控制匹配数量 [2022-4]在实时设计中：
- 部署模型时，会自动选择合适的 KNIME 协议并上传最新版本的协议 [2022-4]- 从模型管理页面控制计算的分发 [2022-4]
- 覆盖现有模型时，可以保留 LiveDesign 管理页面中的模型更改 [2022-4]- 用于移动、存档和取消存档模型的新管理节点 [2022-4]
基于经验和 QM 的 pKa 预测 - Epik 7 的初始版本，这是一个基于机器学习的新应用程序，用于快速 pKa 值和质子化状态预测
[2022-4]。
Epik 7 还可以生成一个图，给出状态群体作为 pH
值的函数 德斯蒙德分子动力学 - 在轨迹图中 查看蛋白质残基的拉马钱德兰图 [2022-4]AutoQSAR - 在 DeepAutoQSAR 中添加用于配体特征化的 MACC 键 [2022-4]- 在 DeepAutoQSAR
超参数优化中包括弹性网CV模型（强 l1/l2 正则化线性回归） [
2022-4]
- 新的 DeepAutoQSAR 命令行实用程序，更易于使用 [2022-4]半经验量子力学
- GFN2-xTB 方法现已在半经验模块面板中提供 [2022-4]
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Scorg 2022 完美激活版
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